דו"ח מבקר המדינה, מיכה לינדנשטראוס, לשנת 2012, שהתפרסם ביום 1.5.2012 מצא ליקויים רבים וחמורים במערכי הרישום והגבייה של החובות למדינה, המסתכמים בעשרות מיליארדי שקלים. הדו"ח קובע, כי "התהליכים הלקויים של רישום החובות וניהולם פוגעים פגיעה ממשית באמינות הדו"חות הכספיים וביכולת המדינה לגבות חובות וגורמים להפסדים לקופת המדינה.
עפ"י הדו"ח, נישומים עסקיים ופרטיים חייבים לגופים ממשלתיים שונים כ-61 מיליארד שקלים שנרשמו בדו"חות הכספיים כ"חובות מוכרים", ו-60 מיליארד שקלים נוספים שנחשבים ל"חובות בלתי מוכרים" ופורטו רק בביאורים לדו"חות הכספיים ולא בדו"חות עצמם, בשל בעיות מדידה או סיכויי גבייה נמוכים. לאחר הביקורת הקשה, המבקר כותב בדו"ח:"על הממשלה לפעול באופן מערכתי ונחרץ לייעול גביית החובות, בתחומי החקיקה והנהלים, הסמכות והאחריות".
