העדכון כולל, בין היתר, הוספה ו/או עדכון הגדרות חדשות; נהלים כיצד מגישים בקשה להחזר מס תשומות ומהי דרישת המסמכים הרלבנטיים שיש לצרף לכל בקשה, בהתאם למהות ההחזר; כללים ואופן הטיפול בבקשה להחזרי מס תשומות ע"י תחנת מע"מ.
♦ עוד מתייחס הנוהל להוראות סעיף 91 לחוק בעניין הזכות של המנהל לעכב החזר מס תשומות ואי הזכאות לעיכוב החזר מס תשומות שאינו שנוי במחלוקת.
♦ כמו כן, במקרים מסויימים בהן מס התשומות הנדרש להחזר שנוי במחלוקת, ניתן לקבלו חזרה תוך העמדת בטוחה ראויה לדוגמה העמדת מקרקעין כבטוחה – רצ"ב נספח א' לנוהל.
